課程介紹:

GenomeDigger提供進階搜尋(Advanced Query)、瀏覽基因體的功能，能夠協助使用者搜尋所定義之特定因體區域，並以此為核心，開發出一套web-based genome browser來整合並呈現基因體資料。有別於一般的genome browser，GenomeDigger所提供之genome browser強化了與使用者的互動性，使用者可自訂基因體資料的呈現方式，例如：指定基因的形狀、顏色、字型等等；另外，數值類型的資料也可以使用長條圖或折線圖的方式呈現。
除此之外，GenomeDigger也整合兩個基本的序列分析軟體，提供使用者於線上使用、並且將結果視覺化呈現在genome browser上，方便使用者獲得初步資料檢視之概況；而這兩個軟體分別是提供序列比對的blastn，以及motif搜尋軟體MOODS，皆為初步序列分析常用之軟體。
本課程為介紹性課程,將針對GenomeDigger所提供之genome browser介面及進階搜尋功能進行介紹。
Genome Digger工具網址: Genome Digger
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課程時間：2013／9／13 上午9：30～12：00
參加對象: 對於細菌基因體瀏覽方式有興趣的生物學者，尤以研究基因調控為佳
上課地點:陽明大學圖資大樓4樓401室(交通方式下載)
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