2017/1/17基因體比較與應用 (陽明大學)
週五, 12/30/2016 - 15:40 | bct
您是否曾經想要瞭解手邊的特有物種與其他物種的差異為何,
或是想要知道什麼樣的機制造成它有獨特的生物功能?
陽明大學 系統與合成學研究中心(簡稱陽明系合中心)已累積深厚比較基因體分析經驗,將於1/17舉辦 「基因體比較與應用」演講,本次活動將與您分享我們如何使用適當的工具進行分析,進而準確解讀資料。本次演講不收費,歡迎報名參加,謝謝。
日 期: 2017年1月17日(星期二)中午12:10~13:20
地 點: 陽明大學圖資大樓4樓403室(座位 40 位)
內容大綱:
* 整合Ensembl compara pipeline及各式比對工具的完善解決方案
* 基因體比較分析應用實例: 跨物種分析案例說明與結果解讀
議 程:
12:00~12:10 報到取餐 (餐點數量有限, 以預先報名者優先領取)
12:10~13:00 基因體比較與應用
13:00~13:20 問題與討論
全基因體註解及跨物種比對
服務說明:
由於新世代定序技術日益增長,定序價格也日益便宜,新物種之全基因體研究也因此展露頭角,因應此需求本單位提供全基因體註解以及跨物種比較分析服務(如下圖)。本服務提供高品質之組裝以及基因註解結果,以及全基因體之跨物種比對結果(全基因體序列排比、基因演化樹分析),除此之外,還提供您整合及視覺化工具(Ensembl VM)來觀看分析結果。透過此分析將可系統化地找出不同物種間之基因體序列差異(如:insertion, deletion, inversion…等)以及基因層次差異,提供您作為後續實驗之依據。
技術優勢:
[活動]2017/2/13~2/20 Ensembl Genome Browser 2017
週四, 12/15/2016 - 10:44 | bct
Ensembl Genome Browser 2017
在歐洲生物資訊研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)例行舉辦的Ensembl Workshop 將移師台灣舉辦。分別在國立中興大學(台中),國立成功大學(台南),國立台灣大學(台北),國立陽明大學(台北)共計四場,整天的教育訓練。
Ensembl是國際上知名的基因體資訊視覺化呈現工具,使用方式是以網頁瀏覽器的方式連到固定網址,在經過查詢之後,即可找到使用者需要檢視的基因體區段。以人類基因體為例,透過簡單的設定,可以進一步瀏覽到整合自1000genome,ENCODE,dbSNP,各種公開的Array實驗資料,等各種豐富資訊,可提供研究討論之用。
Ensembl Genome Browser 教育訓練,主要內容為介紹 Ensembl 網頁工具的操作,讓您可以透過網頁介面快速地找出在基因體參考序列上有興趣且具生物意義的區段,訓練內容非常適合生物領域相關的研究所者、學生參加。歡迎報名,本次教育訓練不收費,並以全英語進行,限定名額 40 名,敬請請把握報名時機。