分析資料處理及視覺化-致病變異篩選
服務說明:
從新世代定序結果中,往往可以找出數以千計甚至數以萬計的變異結果,若再加上實驗的樣本數目眾多,要從眾多變異列表中篩選出有意義的變異就變得很困難,因此,本單位除了提供新世代定序資料分析外,還提供客製化變異為點篩選之服務,替您有效率地找尋有意義的變異。
服務範例:
資料內容:19個病人在20個目標基因上的變異註解資訊(包含:SNV, SV, CNV),共88,949筆變異位置,每筆變異位置有34個不同資訊。
分析目標:篩選出所有病人共有並具有高度影響的變異位點,並同時知道各變異座落之基因以及病人之allele類型。
私人Ensembl基因體瀏覽器(Ensembl VM)
服務說明:
一般常見的生物資訊分析服務提供一張張的分析報表,這樣的結果往往很難做跨實驗或是跨樣本整合分析,此外,若沒有良好的檔案控管,這些分析結果以後很難再被利用,因此本單位提供獨特的Ensembl VM服務,將新世代分析結果儲存及整合至Ensembl資料庫,並建立專屬之Ensembl基因體瀏覽器,使用者可以很容易地在自己的電腦(甚至是筆記型電腦)建立私人的基因體資料庫,便可以利用它以圖形化方式檢視分析結果,以及利用Ensembl提供之工具(如下圖)。除了整合自行定序的物種,我們也可以協助整合所有公開網站可以獲得的基因體資料,並建立專屬Ensembl瀏覽器。