全基因體註解及跨物種比對
服務說明:
由於新世代定序技術日益增長,定序價格也日益便宜,新物種之全基因體研究也因此展露頭角,因應此需求本單位提供全基因體註解以及跨物種比較分析服務(如下圖)。本服務提供高品質之組裝以及基因註解結果,以及全基因體之跨物種比對結果(全基因體序列排比、基因演化樹分析),除此之外,還提供您整合及視覺化工具(Ensembl VM)來觀看分析結果。透過此分析將可系統化地找出不同物種間之基因體序列差異(如:insertion, deletion, inversion…等)以及基因層次差異,提供您作為後續實驗之依據。
技術優勢:
- 系統化尋找物種間基因體序列差異、基因差異。
- 所有分析結果皆整合至基因體瀏覽器(Ensembl VM),優點:a) 差異可以圖形化方式呈現,方便結果判讀;b) 提高分析結果之再利用性。
- 可與公開資料庫(如:NCBI)之物種進行比較。
- 優良的品質控管流程確保分析結果之正確性。
應用範例:
- 致病細菌之毒性因子尋找
- 本土分離菌株之特性因子尋找