生物資訊分析服務
由於生物資訊分析內容會因目的、資料類型、數量以及現有可取得數據之不同而有所差異,要如何從巨量的資料中找尋研究的重點,除了一開始「實驗設計」的重要性之外,還需要有經歷豐富的生物資訊專家給予建議。因此,建議您一開始從實驗的設計階段,就可以先申請本核心所提供的諮詢服務,讓生資專家從資料分析的角度提供最合適的建議以及最完善的分析規劃、解析您的需求與瓶頸,以及量身打造最合適的「客製化生物資訊分析」套裝。以下為本核心生資組的套裝服務範例及細詳服務內容:
特色服務:
分析服務範例:
>> 欲尋找造成單基因顯性遺傳疾病之致病變異,本核心為其規劃之分析套裝如下:
* 實驗設計諮詢(包含:實驗及分析內容設計、樣本挑選)
* G4. SNP array Analysis - 利用連鎖分析進行致病變異之定位
- 資料品質分析
- 連鎖分析 (linkage analysis)
* N2. exome sequencing data analysis - 針對已定位之疾病相關外顯子區域挑選病人特有並會造成嚴重影響的變異位點
- 資料品質分析
- 變異位點分析及功能註解
* C1. data integration (e.g. integrating public and private data),
* C5. clustering or classification
- 與開放數據整合(e.g. dbSNP, TCGA etc.)並進行變異篩選、結果視覺化
分析服務項目:
服務代號 | 服務項目 |
N | NGS related services |
N1 | targeted sequencing data analysis |
N2 | exome sequencing data analysis |
N3 | whole genome sequencing data analysis (真核、原核) |
N4 | RNA sequencing data analysis |
N5 | miRNA sequencing data analysis |
N6 | assembly of NGS sequences (e.g. PacBio, Illumina etc.) |
N7 | microbiome sequencing |
N8 | others |
G | Other high-throughput analysis |
G1 | genome-wide association study(GWAS) |
G2 | expression array analysis |
G3 | other SNP array analysis |
G4 | targeted genotyping |
G5 | others |
C | Customized Services |
C1 | data integration (e.g. integrating public and private data) |
C2 | data comparison (e.g. Ensembl comparative pipeline) |
C3 | integration of clinical data |
C4 | machine learning |
C5 | clustering or classification |
C6 | Ensembl VM (for data visualization) |
歡迎您提出生資服務申請,待收到您的申請書後,將會有專人與您聯繫安排諮詢會議。
請填寫線上申請表, 謝謝。
若您因使用本核心之服務進而發表論文,煩請能誌謝本核心設施,並提供已發表之論文檔案, 謝謝。