歡迎參加-8/12~8/16 新世代定序數據分析在轉譯醫學上的應用(陽明大學)
臺灣生物資訊聯盟將於2013年8/12~8/16於陽明大學舉辦｢新世代定序數據分析在轉譯醫學上的應用」課程，歡迎有興趣的人員報名參加。以下為本此課程說明:
[目標] 在不久的未來，定序方法將進入第三代，資料處理又將有很大的改變。對生物背景的學者而言，應讓專業的國家級生物資訊核心設施來做處理，而沒有必要學習這些操作。因此本課程強調如何「分析」與「解讀」處理好的數據，找出有意義的變異，並探索這些變異與生命現象間的關係，以應用到各個生物醫學領域。
[特色] 以本校所發表的真實研究成果為範本，編寫實驗課程教材，讓學員深刻體認如何將理想落實到操作。課程中將為學員分組，提供各組新世代定序結果數據，讓其合作分析、討論、解讀數據的意義，探索基因體變異可能和人類疾病之關聯。讓其由做中體會，如何有效的利用新世代高通量技術於轉譯醫學的研究。
本課程將以"可全程參加者"為第一優先錄取順序
[研習課程]利用Trio Affymetrix SNP array分析人類染色體結構(2013/8/30@陽明大學)
課程時間：2013／8／30 下午14：00～17：00
上課地點:陽明大學圖資大樓4樓401室(交通方式下載)
上課文件:下載
報名方式：請填寫下方報名表。
本次課程將介紹兩項工具，分別如下：
工具一：TrioSNP viewer:使用病例及其父母共三人的Trio affymetrix SNP晶片分析人類染色體結構
介 紹：晶片式比較性基因體雜合技術(Array Comparative Genomic Hybridization analysis, array-CGH)，比傳統染色體檢查有更高的解析度，為利用DNA probe偵測檢體與對照組DNA，並比較特定位置的probe DNA有增加(gain)或減少(deletion)的copy number variation (CNV) 現象。目前應用在探討異常基因體變化與疾病的相關性產前基因體檢測技術。
[研習課程]A cloud-based genomic data exploration guider：GenomeDigger(2013/9/13@陽明大學)
課程介紹:
GenomeDigger提供進階搜尋(Advanced Query)、瀏覽基因體的功能，能夠協助使用者搜尋所定義之特定因體區域，並以此為核心，開發出一套web-based genome browser來整合並呈現基因體資料。有別於一般的genome browser，GenomeDigger所提供之genome browser強化了與使用者的互動性，使用者可自訂基因體資料的呈現方式，例如：指定基因的形狀、顏色、字型等等；另外，數值類型的資料也可以使用長條圖或折線圖的方式呈現。
除此之外，GenomeDigger也整合兩個基本的序列分析軟體，提供使用者於線上使用、並且將結果視覺化呈現在genome browser上，方便使用者獲得初步資料檢視之概況；而這兩個軟體分別是提供序列比對的blastn，以及motif搜尋軟體MOODS，皆為初步序列分析常用之軟體。
本課程為介紹性課程,將針對GenomeDigger所提供之genome browser介面及進階搜尋功能進行介紹。
Genome Digger工具網址: Genome Digger