麻省理工學院(MIT) 的Prof. Eric J. Alm 2014/8/25將於陽明演講,歡迎踴躍參加
講題:
The ecology of the human microbiome in health and disease
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講者簡介:
Eric J. Alm
Karl Van Tassel (1925) Career Development Associate Professor of Civil and Environmental Engineering and Biological Engineering
Associate Member, Broad Institute
Ensembl 資料庫系統介紹
Ensembl為EMBL - EBI 以及Wellcome Trust Sanger Institute間的合作計畫,目標在於開發一套可以用來產生以及維護基因體註解結果的軟體系統。其中最被廣為利用的就是Ensembl基因體瀏覽器,Ensembl基因體瀏覽器不只可以有系統地整合各種資訊,以人類為例其整合的資訊包含有:
- 基因體組裝資訊
- 基因資訊(包含:coding/non-coding基因、選擇性剪接資訊、蛋白質功能資訊)
- 變異資訊(包含:dbSNP、HGMD、COSMIC…等,以及族群變異資訊:1000Genomes、HapMap)
- 基因調控資訊(ENCODE)
- 物種比較分析資訊
並可以透過良好的圖形化介面呈現結果。請參見:http://www.ensembl.org/index.html
新世代定序結果分析 雲端化流程整合平台 DR. RAW 之介紹
臺灣生物資訊聯盟 (E3) 已於國內大型計算及主要雲端設施,佈署DR. RAW雲端化定序資料分析流程整合平台,為國內學者以及亞太區轉譯醫學產業,提供國際級新世代定序資料分析之能量,以滿足未來多樣性個人化醫療產品之開發及商業應用所需。
本核心設施,延伸阿茲海默症DRAW+SneakPeek之分析流程,加入 RNA-seq 分析與更多的品管之能力,建置『DR. RAW』註 - 雲端化的新世代定序分析流程,特點如下:
– 加入本核心獨有之分析程序 (如適合臺灣定序之品質管制、性染色體之定序深度)
– 更新至國際通用之最新版分析工具,並加入敏感度較高之比對工具
[課程]新世代定序結果分析之應用(2014/9/5(五)@高雄長庚紀念醫院)
課程時間:2014/9/5 (五) 10:30~12 : 00
*此為免費課程
議程:
時間 | 課程名稱 | 講者 |
10:00 - 10:30 | 報到 | |
10:30 - 12:00 | 黃彥華博士 | |
上課地點:高雄長庚紀念醫院兒童大樓6樓國際會議室藍廳