課程名稱：新世代定序結果分析 雲端化流程整合平台 DR. RAW 之介紹

（DR. RAW - A cloud-based integrated platform for the quality control and data analysis of NGS (next-generation sequencing) results）

課程時間：2014／5／2（五）16:00 ~ 17:30

講者：黃彥華博士

上課地點:陽明大學圖資大樓4樓402教室(交通方式下載)

課程簡介：介紹「新世代定序結果分析」流程整合平台 DR. RAW

課程講義：下載

課程目標：

        臺灣生物資訊聯盟 (E3) 將於國內大型計算及主要雲端設施，佈署DR. RAW雲端化定序資料分析流程整合平台，為國內學者以及亞太區轉譯醫學產業，提供國際級新世代定序資料分析之能量，以滿足未來多樣性個人化醫療產品之開發及商業應用所需。

        本核心設施，延伸阿茲海默症DRAW+SneakPeek之分析流程，加入 RNA-seq 分析與更多的品管之能力，建置『DR. RAW』^註 - 雲端化的新世代定序分析流程，特點如下:

–      加入本核心獨有之分析程序 (如適合臺灣定序之品質管制、性染色體之定序深度)

–      更新至國際通用之最新版分析工具，並加入敏感度較高之比對工具

–      已在本核心設施安裝成功，目前正在國研院國網中心測試 (預計2014/06上線服務)

–      未來將可廣泛安裝至國內各學研、甚至各大商用雲端設施。

品質控管之重要性 :

•    每個樣本的分析結果，未來可能關係到個人化診斷與療法之選擇，因此，樣本處理及實驗進行的流程，要全部資訊化管理，才能確保品質及安全性。

•    參與國際合作時，會牽涉到大量樣本的實驗及數據分析，要有高品質及全面性之流程資訊管理系統配合，臺灣生醫界才有成為區域研究及資料整合中心之資格。

註:DRAW (DNA Resequencing Analysis Workflow) +SneakPeek是美國賓州大學王立三老師團隊及阿茲海默症研究中心，為分析阿茲海默症的Exom sequencing資料，所組合成的新世代定序結果分析之雲端系統。全部使用open-source之軟體元件。在北美已經成為Amazon EC2上的一個雲端服務 (Lin, CF, et al. 2013, Bioinformatics)。

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