生物調控原理

Principles of  biological regulation

(一)課程資訊

1. 授課教師: 楊永正老師
2. 開課時間: 105/2/19-6/17, 每星期五5、6節( 13:20-15:10)
3. 地點: 陽明大學圖資411
4. 授課對象: 博、碩士班研究生。若經老師同意，大學部同學亦可選修

(二)課程內容

1. 解讀實驗數據是許多同學覺得困難之處，例如觀察到協同作用(synergy)後，接下來究竟該怎麼做，才能瞭解產生協同作用的機制。本課程將由基本的化學開始，說明核酸與蛋白質，或蛋白質與蛋白質交互作用的原理，並瞭解合作現象(cooperativity)的性質。由這些分子間的作用可以理解反應的規律，例如利用正迴饋的機制，可以在短時間內放大訊號，產生快速的反應。以這些規則為基礎，可以再進一步探究哪些反應會連接在一起形成模組，例如怎樣的線路可以在兩個不同的狀態間切換。透過比較代謝路徑、訊息傳導路徑、轉錄調控等巨分子合成的路徑，可以找到許多調控的模組。知道的模組越多，就越能推測在現象背後的反應機制。例如瞬間的(transient)訊號如何啟動細胞分化?如何維持分化的不可逆性? 這些知識有助於我們猜測未知系統的機制，也有助於設計一個生物網路，達到特定的功能。
2. 本課程會由方法學下手，說明如何解讀數據。再以生化與分子生物學中的反應路徑為例，說明生物調控的規則與原理。希望利用規則說明雜亂無章的現象，並進一步推薦解決問題的步驟。此外、也會簡介現代生物學中的生物資訊學、系統生物學、合成生物學方法，讓同學瞭解尋找這些規則的策略，與應用這些規則解讀反應機制的整套策略。

(三)參考文獻

1. Campbell, A.M. and Heyer, L.J. (2007) Discovering genomics, proteomics, and bioinformatics. (2nd Ed.) Pearson Education, Inc. (QH447.C187 2007)
2. Hancock, J.T. (2005) Cell signalling (2nd Ed). Oxford University Press. (ISBN 0 19 926467 8; QH604.2 H234 2005)
3. Alon, U. (2007) An introduction to systems biology: design principles of biological circuits. Boca Raton, FL :Chapman & Hall/CRC,c2007. (ISBN 1584886420; QH324.2/.A46 2007)
4. 其他相關文獻約10篇

(四)課程大綱與授課進度規劃

(五)課程資訊下載：

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